Согласно письму Министерства финансов РФ от 03.12.08 №03-04-07-01/244, сведения о доходах физических лиц - работников обособленного подразделения организации могут представляться в налоговую инспекцию по месту нахождения обособленного подразделения.

Министерство финансов ссылается на п.2 ст.230 НК РФ, которым установлено, что российские организации – налоговые агенты, должны представлять сведения о доходах физических лиц по месту учета. Организация, имеющая обособленные подразделения, должна встать на учет в налоговом органе по месту нахождения данных подразделений, следовательно, она обязана перечислять исчисленные и удержанные суммы налога, как по месту своего нахождения, так и по месту нахождения каждого своего обособленного подразделения.